Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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CENPFP49454 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CENPFP49454 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CENPFP49454 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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CENPFP49454 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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CENPFP49454 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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CENPFP49454 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CENPFP49454 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CENPFP49454 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CENPFP49454 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CENPFP49454 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CENPFP49454 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CENPFP49454 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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CENPFP49454 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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CENPFP49454 TNC-202ENST00000350763 7641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CENPFP49454 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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