Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MCAMP43121 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCAMP43121 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
MCAMP43121 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCAMP43121 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCAMP43121 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCAMP43121 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCAMP43121 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCAMP43121 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCAMP43121 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCAMP43121 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MCAMP43121 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
MCAMP43121 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
MCAMP43121 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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