Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD12P35452 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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