Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 KCNIP4-201ENST00000359001 2168 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AP004607.6-201ENST00000525033 1202 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
HOXD10P28358 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 CFI-205ENST00000512148 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
HOXD10P28358 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms