Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 IGLV3-32-201ENST00000390303 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 OR4A8-201ENST00000418689 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AL590730.1-202ENST00000418875 321 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 RPL19P21-201ENST00000424919 591 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 KLF7-IT1-201ENST00000428777 655 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC068137.1-201ENST00000429272 584 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AL604028.1-201ENST00000430643 598 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 CELF2-AS2-202ENST00000432370 1227 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 RPL5P4-201ENST00000434805 886 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 EFCAB14P1-201ENST00000442409 463 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 RN7SL89P-201ENST00000480252 283 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 CLDND1-205ENST00000502288 560 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AL132719.1-201ENST00000554515 423 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC114546.2-201ENST00000560683 477 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 ZNF208-202ENST00000597040 781 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AL391903.2-201ENST00000614532 247 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
BHLHE41Q9C0J9 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 RAD54B-202ENST00000336148 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 C2orf80-201ENST00000341287 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 IFI44-201ENST00000370747 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 CTSLP8-201ENST00000413075 967 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
BHLHE41Q9C0J9 EEF1A1P27-201ENST00000429983 1135 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms