Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SHEQ5VZ18 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms