Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC01980-202ENST00000425195 491 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PRKAR1AP1-201ENST00000441422 1162 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC008620.1-201ENST00000468453 592 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC027315.1-201ENST00000511592 469 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL590095.1-201ENST00000420049 436 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDCD1Q15116 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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