Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 EEF1A1P28-201ENST00000450915 1403 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MAPK10-207ENST00000395166 3085 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NDUFB4-201ENST00000184266 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC090774.4-201ENST00000578888 1372 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC022306.1-201ENST00000560489 1562 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
RAB39AQ14964 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms