Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AC010624.4-201ENST00000597606 1351 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
CHAF1AQ13111 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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CHAF1AQ13111 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.64□□□□□ -1.19
CHAF1AQ13111 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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