Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXD4Q12950 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC027288.1-201ENST00000548359 816 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LYZ-202ENST00000548839 558 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC016542.3-201ENST00000623520 619 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL157698.1-201ENST00000415190 1011 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC134879.1-201ENST00000426062 394 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC018804.1-201ENST00000430381 618 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXD4Q12950 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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