Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 IGLJ2-201ENST00000390322 175 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC104076.1-201ENST00000428080 265 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AP001469.2-201ENST00000444966 390 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AP002026.1-204ENST00000506454 749 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC117383.2-201ENST00000514722 322 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ECI2-204ENST00000380125 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 ALOX5AP-201ENST00000380490 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC023141.1-201ENST00000419418 379 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 SCDP1-201ENST00000455244 1081 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CHRNEQ04844 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1420.9 ms