Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 CSMD2-205ENST00000373381 13698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 IL22RA2-201ENST00000296980 2886 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 CDK19-203ENST00000413605 6007 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 LINC01918-202ENST00000438148 415 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 ATP2B4-203ENST00000357681 8968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
PTPRMP28827 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms