Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SRRM4A7MD48 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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