Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 HSPA4L-201ENST00000296464 10790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 PAX6-231ENST00000606377 6901 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 ZNF471-201ENST00000308031 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 ZFYVE26-201ENST00000347230 9675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
XIRP2A4UGR9 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 SLC30A8-201ENST00000427715 5430 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 PCDH11Y-202ENST00000333703 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 HRNR-201ENST00000368801 9623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 BSN-201ENST00000296452 15955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 RASGRP3-202ENST00000403687 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
XIRP2A4UGR9 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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