Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 NIPBL-202ENST00000448238 8729 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
SCN11AQ9UI33 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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