Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CLIP2Q9UDT6 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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