Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
GTF3C6Q969F1 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.5 ms