Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RPL5P3-201ENST00000493817 889 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC130456.5-201ENST00000569345 510 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC010615.2-205ENST00000599993 929 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PWRN1-211ENST00000568609 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SLC9B1P3-201ENST00000452667 1334 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SMR3A-201ENST00000226460 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TRAV6-201ENST00000390428 404 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 HLA-DQB1-AS1-201ENST00000419852 552 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL121917.1-202ENST00000424434 367 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MTRF1-204ENST00000430347 557 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RN7SL308P-201ENST00000464971 297 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC137767.1-202ENST00000543072 752 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 CRADD-211ENST00000552983 839 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTF1Q16619 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms