Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MTCO1P55-201ENST00000489829 745 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
USF2Q15853 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC126474.2-201ENST00000623268 1750 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL139135.1-201ENST00000412675 209 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
USF2Q15853 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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