Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
TAF1AQ15573 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
TAF1AQ15573 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms