Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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CHD4Q14839 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CHD4Q14839 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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