Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC016144.1-201ENST00000548175 1087 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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ATP1A4Q13733 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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ATP1A4Q13733 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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ATP1A4Q13733 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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ATP1A4Q13733 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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ATP1A4Q13733 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ATP1A4Q13733 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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