Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SLFN5-203ENST00000592325 1225 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC01837-204ENST00000593211 570 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC113554.1-201ENST00000606284 490 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC091953.4-201ENST00000625179 341 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL845331.3-201ENST00000562821 2028 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 UBAP2L-202ENST00000343815 3411 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CAST-213ENST00000504465 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 HDAC9-212ENST00000432645 3099 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MCC-209ENST00000515367 3844 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ARG1-203ENST00000368087 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 DCAF4-212ENST00000553457 2896 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 EPN2-204ENST00000395620 3860 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SERPINA9-203ENST00000380365 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MAPK10-313ENST00000641405 2469 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 DCP1A-201ENST00000294241 1853 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 GJB7-203ENST00000525899 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 VTRNA1-2-201ENST00000365241 89 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC009228.1-201ENST00000413254 240 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CLN3Q13286 AP001042.1-201ENST00000416842 487 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CLN3Q13286 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 FTH1P7-201ENST00000450676 552 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CLN3Q13286 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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CLN3Q13286 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CLN3Q13286 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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CLN3Q13286 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZNF611-202ENST00000453741 4380 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 GLI1-201ENST00000228682 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AURKA-204ENST00000395907 1902 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 TM4SF1-201ENST00000305366 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 ZNF215-202ENST00000414517 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
CLN3Q13286 AP4S1-204ENST00000542754 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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