Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
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