Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC009269.1-203ENST00000496414 828 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC025188.1-201ENST00000507514 600 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC069234.3-201ENST00000544939 569 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 LINC02284-201ENST00000558120 573 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 DYDC2-201ENST00000256039 1842 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AL135785.1-201ENST00000422554 399 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AL157896.1-201ENST00000451617 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC025430.1-201ENST00000561324 498 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
IFFO1Q0D2I5 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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