Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 OR10A4-201ENST00000379829 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 DNASE1L3-201ENST00000394549 1294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AL357143.1-201ENST00000457239 934 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 S100B-203ENST00000397648 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 SOD1P1-201ENST00000407803 440 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC078950.1-201ENST00000538349 550 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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CASQ1P31415 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CASQ1P31415 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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