Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SSU72P8-201ENST00000473520 585 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC112219.1-201ENST00000491567 947 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC008592.1-201ENST00000503091 665 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LINC01397-201ENST00000554808 579 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC005154.6-201ENST00000598361 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LINC01198-208ENST00000599175 560 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LINC02532-210ENST00000606430 584 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RN7SL715P-201ENST00000606972 286 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CRNDE-214ENST00000637011 865 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC006213.1-202ENST00000589021 2176 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LINC01568-201ENST00000554640 2544 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 IL24-202ENST00000367093 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 NOS1-202ENST00000338101 4462 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 FRMPD2-213ENST00000636244 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 GJB2-201ENST00000382844 2309 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 TRIM60-204ENST00000512596 1888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 DNAI1-201ENST00000242317 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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PTPREP23469 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AL592464.2-201ENST00000457440 607 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC116353.1-201ENST00000489727 316 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC068134.3-201ENST00000513620 788 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC044839.1-209ENST00000529769 878 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC013489.1-201ENST00000561140 598 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTPREP23469 AC006441.3-201ENST00000580121 456 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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