Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ZNF540-206ENST00000589117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC011379.1-201ENST00000508713 3025 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 TNPO1-201ENST00000337273 11183 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 CHRM3-201ENST00000255380 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PDGFDQ9GZP0 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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