Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 SCP2-207ENST00000435345 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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PDK4Q16654 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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PDK4Q16654 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PDK4Q16654 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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