Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AKR1B15-201ENST00000423958 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CMAHP-203ENST00000458373 1101 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC109454.1-201ENST00000471205 498 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RN7SL89P-201ENST00000480252 283 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CC2D2A-207ENST00000507954 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC103740.1-204ENST00000557994 570 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC063923.2-201ENST00000562158 928 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC01989-201ENST00000566930 1081 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC015853.3-201ENST00000570974 478 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 DSG1-AS1-204ENST00000581856 669 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 MCM3AP-AS1-207ENST00000588753 589 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 MIR6761-201ENST00000617899 72 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC005383.1-201ENST00000622689 534 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 DDX10P2-201ENST00000417796 2614 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL391380.1-201ENST00000439300 1432 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 IFI44-201ENST00000370747 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC093642.1-201ENST00000412193 565 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 GRM7-AS2-201ENST00000427748 520 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 PRSS48-201ENST00000441586 560 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms