Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
SS18Q15532 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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SS18Q15532 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
SS18Q15532 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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