Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
SYCP1Q15431 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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SYCP1Q15431 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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SYCP1Q15431 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SYCP1Q15431 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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