Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms