Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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