Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 Z82209.2-201ENST00000623410 2012 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 ZNF207-207ENST00000577908 4672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
TCOF1Q13428 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms