Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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TRAF1Q13077 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF1Q13077 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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