Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GRIK2Q13002 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms