Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PTPRMP28827 UBN2-201ENST00000473989 14444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 DST-207ENST00000421834 18030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
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PTPRMP28827 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
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PTPRMP28827 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
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PTPRMP28827 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 PCDH19-201ENST00000255531 7937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 GABPB2-201ENST00000368916 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PTPRMP28827 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
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