Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 CNOT7-201ENST00000361272 6913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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RFXAPO00287 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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RFXAPO00287 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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RFXAPO00287 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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RFXAPO00287 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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RFXAPO00287 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
RFXAPO00287 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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