Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC012360.3-201ENST00000610036 3449 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 CCDC77-202ENST00000412006 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 REG1A-201ENST00000233735 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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FOXQ1Q9C009 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 DAZ2-206ENST00000382440 4119 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 MR1-208ENST00000614012 7860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
FOXQ1Q9C009 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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