Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 ZNF90-201ENST00000418063 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 PIP-201ENST00000291009 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC092421.1-201ENST00000448148 418 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC097375.1-201ENST00000507949 488 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 LINC01440-208ENST00000627300 699 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 HBG1-202ENST00000632727 369 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 SPOCK1-201ENST00000282223 4488 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 OR52K3P-202ENST00000641797 1729 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 OR10AD1-201ENST00000310248 1305 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AC125603.4-201ENST00000621942 2699 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ATG4DQ86TL0 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms