Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LINC00303Q3SY05 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LINC00303Q3SY05 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LINC00303Q3SY05 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LINC00303Q3SY05 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LINC00303Q3SY05 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LINC00303Q3SY05 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LINC00303Q3SY05 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LINC00303Q3SY05 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LINC00303Q3SY05 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LINC00303Q3SY05 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LINC00303Q3SY05 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms