Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 FANCL-203ENST00000403295 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CST13P-201ENST00000376992 428 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL031963.2-201ENST00000433761 398 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RPS4XP23-201ENST00000487801 237 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AP003721.2-201ENST00000536495 452 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RBM22P13-201ENST00000569805 1244 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 MIR4793-201ENST00000577502 87 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC008635.1-201ENST00000600716 562 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 MIR6745-201ENST00000612694 127 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 MIR6737-201ENST00000617385 70 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 PFN1P2-202ENST00000621347 397 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
FXNQ16595 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RN7SKP63-201ENST00000363187 301 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FXNQ16595 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms