Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
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NEUROD1Q13562 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
NEUROD1Q13562 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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NEUROD1Q13562 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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NEUROD1Q13562 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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NEUROD1Q13562 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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NEUROD1Q13562 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
NEUROD1Q13562 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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