Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL136298.2-201ENST00000556497 1570 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL451064.2-201ENST00000623514 1654 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 IFT88-201ENST00000319980 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 DLGAP1-AS3-201ENST00000577649 1258 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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