Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 OR10J9P-201ENST00000511932 987 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 COX7B-203ENST00000481445 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 ENO1P4-201ENST00000416471 1785 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 HNRNPA1P30-201ENST00000424329 751 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
AP3B2Q13367 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms