Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SRSF5Q13243 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms