Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL357153.4-201ENST00000620487 1016 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
TWF1Q12792 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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