Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 LINC01961-201ENST00000449954 745 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 CENPN-204ENST00000428963 971 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AL159174.1-201ENST00000438267 811 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 ENPP7P3-201ENST00000509123 241 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 LINC01146-203ENST00000555996 459 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CXCL3P19876 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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