Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MMACHC-203ENST00000616135 1510 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 GZMA-201ENST00000274306 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 S100A4-201ENST00000354332 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RN7SKP211-201ENST00000363328 315 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FTOP1-201ENST00000419363 861 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC01732-201ENST00000435023 542 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RPS20P23-201ENST00000461683 354 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC022639.1-201ENST00000523191 573 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC00958-202ENST00000526388 607 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC084816.1-211ENST00000540994 485 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC137767.1-202ENST00000543072 752 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 TUBAP4-201ENST00000569261 416 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 CCL4L2-216ENST00000620098 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 AL353898.2-201ENST00000623000 255 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VPREB1P12018 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms